A Biologia Molecular é uma área que envolve diversos conceitos complexos e, muitas vezes, de difícil compreensão pelos alunos. Nesse sentido, considera-se fundamental que esses conteúdos sejam bem trabalhados no ensino médio, exigindo o uso de estratégias que favoreçam a aprendizagem. Este trabalho teve como objetivo caracterizar e analisar a concepção de alunos do 1º ano do ensino médio sobre a síntese de proteínas, utilizando uma atividade didática específica. Foi adotada uma abordagem qualitativa, sendo aplicado um questionário antes e depois da intervenção. Os resultados evidenciaram que as ações desenvolvidas durante a regência contribuíram significativamente para a construção do conhecimento dos alunos acerca do processo de síntese de proteínas. Além disso, observou-se que o uso de metodologias diferenciadas nas aulas de biologia favorece o processo de ensino-aprendizagem.