O Exame Nacional do Ensino Médio (ENEM), criado em 1998 para avaliar a qualidade da etapa final da educação básica brasileira, assume, na atualidade, o papel de um dos mais relevantes meios de acesso ao ensino superior, o que, a cada ano, aumenta seu nível de significância junto à realidade da escola. Logo, por meio de uma abordagem qualitativa e fundamentada nos princípios de uma análise bibliográfica, realizada junto às atas do Encontro Nacional de Pesquisa em Educação em Ciências (ENPEC), buscamos avaliar como o ENEM, na interface com o Ensino de Biologia, tem sido inserido nas pesquisas apresentadas nesse importante evento. É possível inferir, a partir dos artigos analisados, que alguns tópicos, entre os diversos conteúdos discutidos na disciplina de Biologia, tendem a ser privilegiados nas questões do ENEM, algo que também ocorre em relação aos eixos cognitivos.