Atividades experimentais têm sido tratadas como importante recurso na abordagem de conceitos e no desenvolvimento de habilidades relevantes à formação dos alunos. Nesse sentido, a Aprendizagem Baseada em Problemas (Problem Based Learning - PBL) é recomendada para o desenvolvimento de tais habilidades. Neste trabalho, analisamos os diagramas heurísticos feitos por estudantes de Licenciatura em Ciências da Natureza e Química para a resolução de problemas experimentais, baseadas na PBL. Assim, procuramos verificar se esta forma de organização das informações influencia na conceituação dos alunos, a partir de práticas argumentativas. A análise dos diagramas nos forneceu resultados significativos ao ensino de química, especialmente quanto à utilização de atividades experimentais pautadas na PBL, em que pudemos verificar a compreensão dos estudantes acerca dos conceitos abordados no problema, bem como observar a linguagem utilizada por eles e suas dificuldades com relação às suas conclusões, as quais integram o processo de tomada de conhecimento conceitual.