Nos dias atuais é essencial que a educação auxilie de modo eficiente não só na formação do estudante, mas, principalmente de cidadãos ativos e conscientes. Dessa forma, cabe aos professores e educadores o desenvolvimento e a melhoria de métodos de ensino-aprendizagem. De forma que desperte e coloque o indivíduo, não só como mero espectador, mas também como construtor do conhecimento. Assim, este presente trabalho relata a produção e aplicação de vídeos de animação usando a técnica de Stop Motion utilizando massinhas de modelar, com o propósito de simplificar os conhecimentos sobre fagocitose. O roteiro metodológico consistiu em uma oficina Stop Motion, onde os estudantes, com o auxílio dos licenciandos, criaram modelos com massinhas, fotografaram em sequência e posteriormente produziram vídeos para dar a impressão que estão se mexendo. Portanto, a técnica de Stop Motion se mostrou muito importante no auxilio e desenvolvimento de diferentes habilidades do estudante, além de ser um facilitador do conteúdo estudado.