As metodologias de ensino ativas podem proporcionar o desenvolvimento de habilidades e competências fundamentais para o êxito do processo de ensino-aprendizagem das Ciências, posto que somente o conhecimento técnico e específico das disciplinas podem não ser suficientes para a formação de um profissional crítico e autônomo no século XXI. O objetivo da pesquisa foi investigar como o desenvolvimento de Metodologias Ativas em Espaços Não-Formais podem contribuir no processo de Alfabetização Científica de educandos do curso de engenharia, bolsistas no Projeto Academia STEM da Universidade do Estado do Amazonas. A metodologia da pesquisa se delineia a partir de uma abordagem qualitativa, seguindo técnicas de observação participante, questionário com perguntas abertas e grupos dialogais. As metodologias ativas desenvolvidas nos Laboratórios Móveis da Academia STEM proporcionam a formação de engenheiros que são mais que técnicos especialistas, mas cidadãos emancipados que conseguem realizar a devida leitura do mundo natural, a partir do conhecimento científico.