Este artigo, recorte de uma pesquisa, apresenta uma discussão a respeito da interdisciplinaridade com o olhar para o contexto curricular, onde, foi realizado um acompanhamento de duas turmas de Estágio supervisionado, uma no curso de Licenciatura em Química e outra no curso de Licenciatura em Ciências Biológicas da Universidade Federal de Pelotas, com registros em Diário de Bordo e utilização de questionários. A análise dos dados se deu através de uma aproximação com a perspectiva do método de Análise Estrutural do Fenômeno Situado, os resultados mostram que estagiários e professores reconhecem a complexidade da interdisciplinaridade no ensino, sendo o enrijecimento curricular e a falta de compreensão sobre a perspectiva, as maiores dificuldades encontradas.