O presente trabalho busca analisar propostas de Ensino por Investigação no ensino de Ciências/Biologia em Sequências de Ensino Investigativo (SEI) dos Anos Finais do Ensino Fundamental. Para tal, optou-se por uma pesquisa do tipo qualitativa por meio da Revisão Sistemática de Literatura. Assim, foi selecionado um recorte temporal de 2017 a 2022, em que foi realizada uma busca avançada nas plataformas: a Base Digital Brasileira de Teses e Dissertações, o Encontro Nacional de Pesquisa em Educação em Ciências e o Encontro Nacional de Ensino de Biologia. Com isso, foi possível compreender como são planejadas e aplicadas as SEI direcionadas ao ensino de Ciências/Biologia, destacando aspectos importantes no que diz respeito a atividades investigativas que valorizam os processos de construção do conhecimento biológico por meio dos métodos como a observação, a comparação, a experimentação, a montagem com seres vivos, bem como a importância de materiais e espaços da escola.