Este estudo percorre a história da pesquisa educacional brasileira, influenciada pela política e a epistemologia, buscando perceber os paradigmas científicos em cada época, dialogando sobre as instituições, seus papéis e as escolhas metodológicas subjacentes. Nosso objetivo é estabelecer uma análise histórica sobre o percurso da pesquisa em educação focado nas naturezas metodológicas. Pretendemos também apresentar uma reflexão crítica sobre as possibilidades de contribuição dos métodos mistos em pesquisa educacional, onde percorremos uma diversidade de estudos e abordagens científicas entre a pesquisa em educação e o campo epistemológico. Utilizamos da análise narrativa como método para constituímos um viés histórico sobre a formulação e utilização das diversas naturezas e métodos de pesquisa, dialogando com estruturas científicas paradigmáticas que influenciam a história da ciência educação. Entendemos que tal jornada deságua nos métodos mistos, como campo possível e instigante na pesquisa educacional, contribuindo ao pensar a colaboração interdisciplinar entre pesquisadores e grupos de pesquisa.