Este estudo tem por objetivo discutir os desafios que se impõe ao professor que tem como compromisso a alfabetização científica. A educação tradicional tem perpetuado uma prática educativa subordinada aos interesses econômicos, que se consolida inclusive na formação dos professores, que muitas vezes se sentem despreparados. Sob a ótica do pensamento complexo os dados nos leva a perceber inúmeros desafios a serem superados, dentre eles a necessidade de o professor estabelecer o dialético processo reflexão-ação-reflexão, para que seja capaz de provocar vivências de uma educação crítica problematizadora. Conclui-se então que uma prática educativa que tem por objetivo a formação de cidadãos críticos requer um professor reflexivo, que invista em abordagens problematizadoras para que o estudante possa em processo de alfabetização científica, ser capaz de fazer a leitura de mundo e tomar decisões em prol do bem estar social, estabelecendo uma relação mais sustentável com a mãe terra.