Ensino de Ciências por Investigação é uma abordagem didática com objetivos conceituais, epistêmicos e sociais, favorecendo aparição dos três domínios do conhecimento científico propostos por Duschl(2008). Há dificuldades em abordar os domínios de maneira equilibrada nos currículos e salas de aulas(Souza & Silva, 2021). Considerando que as concepções dos professores influenciam os objetivos a serem trabalhados (Lotter et al., 2007), é relevante investigar o que os professores pensam acerca dos domínios. Assim, o objetivo do trabalho é analisar as concepções sobre EnCI de professores ao avaliar sequências didáticas investigativas. Assim, foi analisada a transcrição de um curso da Secretaria Municipal de Educação de São Paulo para professores de Ciências. Os episódios foram construídos a partir de pontos de conflitos durante o diálogo. Podemos identificar o papel atribuído pelos professores aos diferentes domínios do conhecimento científico a partir da análise das atividades presentes no Caderno da Cidade do município de São Paulo.