No contexto das demandas de um mundo cada vez mais globalizado e da necessidade de um ensino que promova a cidadania, surgiram as discussões para a inclusão dos Temas Transversais (TT) na educação. Estes temas tratam de questões sociais urgentes e buscam romper com a visão fragmentada do conhecimento, considerando a complexidade do mundo e da própria natureza humana. O objetivo deste trabalho é abordar alguns aspectos da teoria da complexidade de Edgar Morin, relacionando-os à abordagem dos TT no ensino de ciências. A partir das discussões tecidas, entendemos que a proposta dos TT corrobora com os pressupostos da teoria da complexidade, ao buscar a conexão das diferentes áreas do currículo para a obtenção de um conhecimento geral. Assim, ao valorizar a visão de complexidade do mundo nos processos de ensino, permite-se associar os conhecimentos científicos historicamente adquiridos aos conhecimentos construídos a partir das problemáticas atuais e de relevância social.