Este trabalho visa apresentar reflexões teórico-metodológicas sobre o ensino de Ciências nos Anos Iniciais à luz do referencial do Ensino por Investigação, examinando potencialidades desta abordagem metodológica para a alfabetização científica. A Base Nacional Comum Curricular (BNCC) e suas proposições para esta área também é problematizada. Em termos metodológicos, trata-se de um trabalho de natureza teórica, apoiado na revisão de literatura de alguns artigos recentes sobre a BNCC e o Ensino de Ciências. A literatura consultada aponta para um silenciamento da Base no que se refere tanto à indicação de referenciais teóricos que apoiem o planejamento e a prática docentes quanto ao papel fundamental do professor no processo de alfabetização científica.