O ensino de Microbiologia passa por diversas dificuldades, desde a falta de espaços adequados nas escolas para a realização de aulas experimentais até a falta de concepções adequadas dos discentes no que se refere à associação dos microrganismos a doenças. Diante desse contexto, o trabalho teve o objetivo de identificar as concepções dos alunos do 1º ano do ensino médio sobre os microrganismos, em uma escola de rede estadual de ensino localizada na microrregião do Seridó oriental da Paraíba. Os resultados dessa pesquisa servem para os professores do ensino médio analisar e discutirem melhorias nas condições do ensino da Microbiologia haja vista que existe muita negligencia por parte dos alunos sobre o tem em discussão.