O milho (Zea may L.) é uma cultura de relevada importância econômica sendo fonte de alimento para famílias de baixa renda no semiárido do Nordeste. Para que todo seu potencial genético se expresse é de suma importância tratos culturais adequados e boas condições ambientais principalmente precipitação pluviométrica, este último é de grande escassez nas regiões semiáridas. O estresse hídrico é um fator limitante de produção, sendo imprescindíveis plantas adaptadas a essa condição ambiental para incremento na produtividade que se expressa em caracteres agronômicos favoráveis. O melhoramento genético de planta com o auxílio da análise proteômica, dentre outras ferramentas, visa desenvolver genótipos que se adaptem a essas condições extremas. Neste trabalho, objetivou-se identificar peptídeos de híbridos de milho em resposta ao déficit hídrico. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Campina Grande – UFCG campus de Pombal. As plantas foram cultivadas em vasos de 20 L por 90 dias. Os híbridos de milho utilizados foram: Robusto, 2B688PW, AG1051, 2B604PW, 30F53YH e AG8677PRO2. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com 3 repetições e 2 níveis de água (T1 = 30% da capacidade de água do solo; T2 = 60% da capacidade de água do solo). Para a extração de proteínas totais de folhas de milho utilizou-se o método fenol modificado. Dentre os genótipos avaliados, destacaram os híbridos 2B604PW (controle) e 30F53YH (estressado) e em ambos identificaram-se peptídeos relacionados ao estrese hídrico, os quais estão relacionados a vários processos biológicos realizados pelas plantas.