Introdução: A microcefalia é uma malformação congênita em que o cérebro não se desenvolve de maneira adequada. É caracterizada por um perímetro cefálico inferior ao esperado para idade e sexo e, dependendo da sua etiologia, pode ser associada a malformações estruturais do cérebro ou ser secundária a causas diversas. Em geral, as crianças apresentam atraso no desenvolvimento neuropsicomotor com acometimento motor e cognitivo relevante e, em alguns casos as funções sensitivas (audição e visão) também são comprometidas. Dessa forma, o sistema respiratório também é acometido devido às alterações do tônus muscular, gerando uma pobreza dos movimentos e um enfraquecimento dos músculos ventilatórios, promovendo uma déficit nas trocas gasosas. Dessa forma o presente estudo relata a avaliação de um caso com diagnóstico de infecção intrauterina possivelmente associada pelo Vírus Zika, acompanhadas na Clínica Escola de Fisioterapia da Universidade Estadual da Paraíba. Metodologia: Foram utilizados os seguintes instrumentos: Boletim de Silverman-Andersen, para avaliar o grau de desconforto respiratório; a escala de FLACC (Face, Legs, Activity, Cry, Consolability) que avalia a dor em crianças entre 2 meses e 7 anos ou indivíduos incapazes de comunicar sua dor; Protocolo de Avaliação contendo dados pessoais, perinatais, sinais vitais, assim como a Ausculta Pulmonar (AP). Resultados e Discussão: Durante a avaliação do lactente, notou-se que tais problemas respiratórios se iniciaram desde do nascimento, e que estavam presentes desde do respectivo momento, apresentando cansaço para o processo de deglutição, apnéia, cianose na região perioral o que indica forte indício de desconforto respiratório,seguida de expectoração de aspecto mucóide com quantidade moderada e na ausculta pulmonar percebeu-se a presença de estertores crepitantes em AHTx. Todos esses fatores citados estão diretamente relacionados com as alterações neurológicas ocorridas. Além disso, outro fator importante observado é que a medicação potente que o lactente faz uso também pode estar associada com a diminuição da mobilidade ciliar, levando ao acúmulo de secreção. Conclusão: Podemos constatar que a microcefalia é uma doença que acomete vários sistemas e um deles é o Sistema Respiratório, e que isso pode gerar uma série de consequências e desencadear diversas outras doenças quando não se é dado a devida atenção. Faz se necessário, que outros estudos sejam desenvolvidos e que haja um olhar diferenciado buscando melhorar a qualidade de vida dessas crianças.