Este artigo analisa possíveis contribuições da Educação CTS (ECTS) em uma prática formativa desenvolvida com estudantes da educação básica de uma escola pública. O objetivo do estudo foi investigar a percepção dos estudantes do sexto ano do Ensino Fundamental, sobre o descarte de medicamentos em desuso e os impactos para a saúde e o ambiente. É uma pesquisa qualitativa, que teve como estratégia metodológica, os Três Momentos Pedagógicos. Os dados da pesquisa foram analisados sob a ótica da análise textual discursiva. Dentre os resultados, identificamos que a ECTS pode contribuir para o desenvolvimento do letramento científico e para a formação cidadã de estudantes da educação básica, sendo possível perceber em seus discursos, esclarecimentos quanto aos impactos do descarte de medicamentos em desuso para a saúde e o ambiente, como também, a sensibilização e mobilização no círculo familiar, entre outros envolvidos, no incentivo ao descarte indicado para estes medicamentos.