Com a chegada do outono boreal, milhares de aves limícolas Charadriiformes migram de suas áreas de reprodução na região ártica para regiões restritas e específicas de clima temperado e tropical. O estuário do Rio Apodi-Mossoró, no semiárido do Estado do Rio Grande do Norte, é uma das áreas utilizadas anualmente por populações migrantes de aves limícolas no Brasil. Este estudo integrou o conhecimento científico publicado sobre ecologia de aves limícolas no Estuário Apodi-Mossoró entre 1910 e 2016 para a elaboração de uma proposta de mapa estratégico contendo os principais desafios, oportunidades e diretrizes prioritárias para conservação destas espécies de aves na região em estudo. A metodologia utilizada para a construção do mapa estratégico foi a Balanced Scored, a partir da qual representamos graficamente as bases para ação, os processos, os benefícios e os compromissos entre comunidade local, empresários, governos e instituições de ensino e pesquisa, com o objetivo de conduzir uma organização ao alcance da missão e visão de futuro. Esta é a primeira proposta de planejamento estratégico envolvendo o tema ‘conservação de aves limícolas’ para o estuário do Rio Apodi-Mossoró e tem como objetivo fomentar políticas públicas que busquem o estabelecimento de estratégias de conservação da biodiversidade, considerando o desenvolvimento econômico e social da região.