O ensino de Ecologia nos anos finais do Ensino Fundamental é imprescindível para a compreensão da biosfera, porém, quando abordado de forma estritamente teórica, a compreensão da dinâmica ambiental acaba sendo dificultada. Nesse sentido, a adoção de estratégias pedagógicas que promovam a vivência de prática de investigação e exploração são auxiliadores para o aprendizado da temática no ensino de Ciências. Com isso, este trabalho apresenta um relato de experiência da atividade: “Ecossistemas em Miniatura: Oficina de Terrário”, desenvolvida pelo Programa Institucional de Bolsas de Iniciação à Docência (PIBID) com turmas do 6º ao 9º ano de uma escola pública estadual de Alegrete/RS. A atividade teve como objetivo explorar através da construção de mini terrários as relações ecossistêmicas por meio da modelagem científica e do método investigativo. A metodologia contemplou momentos de teoria articulados à coleta de elementos bióticos e abióticos no pátio da escola, possibilitando a construção de uma ponte concreta entre o conteúdo científico e o reconhecimento do ecossistema local. Diferente de registros escritos tradicionais no formato de diários, a sistematização ocorreu por meio da oralidade e de debates em sala de aula, o que permitiu que os estudantes expusessem suas ideias e hipóteses com segurança e fluidez. Diante desta prática, foi possível observar o engajamento e o despertar da curiosidade através da investigação, somados a uma consciência ética que surgiu na preocupação genuína dos estudantes com o bem-estar dos seres vivos no território e a manutenção do mesmo. Essa experiência demonstrou que o uso de modelos didáticos, junto à investigação do espaço escolar, não apenas favorece a alfabetização científica dos estudantes, mas também contribui de forma significativa para a formação da identidade docente ao viabilizar práticas pedagógicas mais participativas e conectadas com a realidade da sala de aula.