EFICIÊNCIA DO GENE MITOCONDRIAL 16S RRNA NA IDENTIFICAÇÃO DE GIRINOS (AMPHIBIA: ANURA) DA CAATINGA ALAGOANA
"2016-11-09 23:00:00" // app/Providers/../Base/Publico/Artigo/resources/show_includes/info_artigo.blade.php
App\Base\Administrativo\Model\Artigo {#1843 // app/Providers/../Base/Publico/Artigo/resources/show_includes/info_artigo.blade.php #connection: "mysql" +table: "artigo" #primaryKey: "id" #keyType: "int" +incrementing: true #with: [] #withCount: [] +preventsLazyLoading: false #perPage: 15 +exists: true +wasRecentlyCreated: false #escapeWhenCastingToString: false #attributes: array:35 [ "id" => 23771 "edicao_id" => 50 "trabalho_id" => 322 "inscrito_id" => 2154 "titulo" => "EFICIÊNCIA DO GENE MITOCONDRIAL 16S RRNA NA IDENTIFICAÇÃO DE GIRINOS (AMPHIBIA: ANURA) DA CAATINGA ALAGOANA" "resumo" => "Das 7.546 espécies de anfíbios atuais alocadas em três ordens (Anura, Caudata e Gymnophiona), Anura inclui aproximadamente 96% desta diversidade. Os anuros apresentam geralmente duas fases, uma larval aquática (girino) e uma adulta terrestre (sapo, rã ou perereca). Dentre os seis biomas que ocorrem no Brasil, a Caatinga ainda não tem atraído tanta atenção e tem sido considerado um bioma com baixa riqueza e endemismo. Estudos recentes desafiaram esta afirmação e revelaram que há um grande déficit de conhecimento acerca da biodiversidade nesse bioma. Em Alagoas, 64% dos municípios situados na Caatinga não apresentam se quer um registro de anuro. Apesar deste conhecimento incipiente sobre a anurofauna da Caatinga alagoana, 30 espécies de anuros (das 72 conhecidas para o estado), já foram registradas, porém são escassos os estudos acerca da biologia desses animais, principalmente em relação a sua fase larval. O grande número de espécies crípticas somada a falta de conhecimento das características diagnósticas de girinos dificultam a identificação utilizando apenas análise morfológica. Entretanto, uma abordagem molecular utilizando um fragmento do gene mitocondrial 16S rRNA (DNA barcode) vem auxiliando na identificação de girinos. Desse modo, o objetivo deste estudo foi verificar a eficiência do gene mitocondrial 16S rRNA como ferramenta para auxiliar na identificação de girinos da Caatinga alagoana. Para a análise molecular foi utilizado tecido da musculatura caudal de girinos coletados na Caatinga e zonas de transição no estado de Alagoas. Onze amostras tiveram o DNA genômico total extraído utilizando o método de extração com sais. Posteriormente foram realizadas reações em cadeia da polimerase (PCR) para a amplificação de 560 pares de base do gene mitocondrial 16S rRNA. As oito amostras funcionais foram purificadas com isopropanol e sequenciadas unidirecionalmente. As sequências foram editadas e alinhadas no software BioEdit juntamente com 49 sequências representando 26 espécies que já foram registradas para a área de estudo. Os dendrogramas foram gerados através do método Neighbour-Joining com o modelo de substituição nucleotídica Kimura-2-parâmetros (K2P) utilizando o software MEGA6. O espécime MUFAL12482 = Hypsiboas sp.5 apresentou haplótipo idêntico com Hypsiboas albomarginatus de Pernambuco e MUFAL12478 = Hypsiboas sp.4 apresentou distância genética de 3,5% com Hypsiboas faber do Brasil. Os espécimes MUFAL12476, MUFAL12477 e MUFAL12479 foram identificados morfologicamente como Dendropsophus minutus e sua identificação morfológica foi corroborada com a molecular (apresentaram haplótipos idênticos e se agruparam com coespecíficos apresentando menor distancia genética [1%] com um espécime do Maranhão e maior distância genética [3,5%] com um espécime da Bolívia). O espécime MUFAL12483 identificado morfologicamente como Phyllomedusa nordestina se agrupou com sequências da mesma espécie da Bahia apresentando distância genética de 3,9. Para a família Leptodactylidae espécime MUFAL12487 identificado morfologicamente somente a nível genérico (Leptodactylus sp.9) se agrupou com sequências de Leptodactylus fuscus (distância genética de 1,6% com o espécime de Pernambuco). Para a família Pipidae, o espécime MUFAL12485 identificado como Pipa carvalhoi se agrupou com coespecífico apresentando distância genética de 3,7%. A utilização do gene mitocondrial 16S rRNA como DNAbarcode se mostrou eficiente na identificação e/ou confirmação das espécies de anuros da Caatinga alagoana." "modalidade" => "Pôster (PO)" "area_tematica" => "GT 01 - Produção do conhecimento: Para quê e para quem" "palavra_chave" => "BARCODE, TAXONOMIA INTEGRATIVA, ANFIBIOS" "idioma" => "Português" "arquivo" => "TRABALHO_EV064_MD4_SA1_ID2154_13102016140205.pdf" "created_at" => "2020-05-28 15:53:09" "updated_at" => "2020-06-10 11:44:17" "ativo" => 1 "autor_nome" => "MARCOS JORGE MATIAS DUBEUX" "autor_nome_curto" => "MARCOS DUBEUX" "autor_email" => "marcosdubeux.bio@gmail.co" "autor_ies" => "UNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS" "autor_imagem" => "" "edicao_url" => "anais-i-conidis" "edicao_nome" => "Anais I CONIDIS" "edicao_evento" => "Congresso Internacional da Diversidade do Semiárido" "edicao_ano" => 2016 "edicao_pasta" => "anais/conidis/2016" "edicao_logo" => "5e4a0993d086e_17022020003339.png" "edicao_capa" => "5f184b878a264_22072020112159.jpg" "data_publicacao" => null "edicao_publicada_em" => "2016-11-09 23:00:00" "publicacao_id" => 33 "publicacao_nome" => "Anais CONIDIS" "publicacao_codigo" => "2526-186X" "tipo_codigo_id" => 1 "tipo_codigo_nome" => "ISSN" "tipo_publicacao_id" => 1 "tipo_publicacao_nome" => "ANAIS de Evento" ] #original: array:35 [ "id" => 23771 "edicao_id" => 50 "trabalho_id" => 322 "inscrito_id" => 2154 "titulo" => "EFICIÊNCIA DO GENE MITOCONDRIAL 16S RRNA NA IDENTIFICAÇÃO DE GIRINOS (AMPHIBIA: ANURA) DA CAATINGA ALAGOANA" "resumo" => "Das 7.546 espécies de anfíbios atuais alocadas em três ordens (Anura, Caudata e Gymnophiona), Anura inclui aproximadamente 96% desta diversidade. Os anuros apresentam geralmente duas fases, uma larval aquática (girino) e uma adulta terrestre (sapo, rã ou perereca). Dentre os seis biomas que ocorrem no Brasil, a Caatinga ainda não tem atraído tanta atenção e tem sido considerado um bioma com baixa riqueza e endemismo. Estudos recentes desafiaram esta afirmação e revelaram que há um grande déficit de conhecimento acerca da biodiversidade nesse bioma. Em Alagoas, 64% dos municípios situados na Caatinga não apresentam se quer um registro de anuro. Apesar deste conhecimento incipiente sobre a anurofauna da Caatinga alagoana, 30 espécies de anuros (das 72 conhecidas para o estado), já foram registradas, porém são escassos os estudos acerca da biologia desses animais, principalmente em relação a sua fase larval. O grande número de espécies crípticas somada a falta de conhecimento das características diagnósticas de girinos dificultam a identificação utilizando apenas análise morfológica. Entretanto, uma abordagem molecular utilizando um fragmento do gene mitocondrial 16S rRNA (DNA barcode) vem auxiliando na identificação de girinos. Desse modo, o objetivo deste estudo foi verificar a eficiência do gene mitocondrial 16S rRNA como ferramenta para auxiliar na identificação de girinos da Caatinga alagoana. Para a análise molecular foi utilizado tecido da musculatura caudal de girinos coletados na Caatinga e zonas de transição no estado de Alagoas. Onze amostras tiveram o DNA genômico total extraído utilizando o método de extração com sais. Posteriormente foram realizadas reações em cadeia da polimerase (PCR) para a amplificação de 560 pares de base do gene mitocondrial 16S rRNA. As oito amostras funcionais foram purificadas com isopropanol e sequenciadas unidirecionalmente. As sequências foram editadas e alinhadas no software BioEdit juntamente com 49 sequências representando 26 espécies que já foram registradas para a área de estudo. Os dendrogramas foram gerados através do método Neighbour-Joining com o modelo de substituição nucleotídica Kimura-2-parâmetros (K2P) utilizando o software MEGA6. O espécime MUFAL12482 = Hypsiboas sp.5 apresentou haplótipo idêntico com Hypsiboas albomarginatus de Pernambuco e MUFAL12478 = Hypsiboas sp.4 apresentou distância genética de 3,5% com Hypsiboas faber do Brasil. Os espécimes MUFAL12476, MUFAL12477 e MUFAL12479 foram identificados morfologicamente como Dendropsophus minutus e sua identificação morfológica foi corroborada com a molecular (apresentaram haplótipos idênticos e se agruparam com coespecíficos apresentando menor distancia genética [1%] com um espécime do Maranhão e maior distância genética [3,5%] com um espécime da Bolívia). O espécime MUFAL12483 identificado morfologicamente como Phyllomedusa nordestina se agrupou com sequências da mesma espécie da Bahia apresentando distância genética de 3,9. Para a família Leptodactylidae espécime MUFAL12487 identificado morfologicamente somente a nível genérico (Leptodactylus sp.9) se agrupou com sequências de Leptodactylus fuscus (distância genética de 1,6% com o espécime de Pernambuco). Para a família Pipidae, o espécime MUFAL12485 identificado como Pipa carvalhoi se agrupou com coespecífico apresentando distância genética de 3,7%. A utilização do gene mitocondrial 16S rRNA como DNAbarcode se mostrou eficiente na identificação e/ou confirmação das espécies de anuros da Caatinga alagoana." "modalidade" => "Pôster (PO)" "area_tematica" => "GT 01 - Produção do conhecimento: Para quê e para quem" "palavra_chave" => "BARCODE, TAXONOMIA INTEGRATIVA, ANFIBIOS" "idioma" => "Português" "arquivo" => "TRABALHO_EV064_MD4_SA1_ID2154_13102016140205.pdf" "created_at" => "2020-05-28 15:53:09" "updated_at" => "2020-06-10 11:44:17" "ativo" => 1 "autor_nome" => "MARCOS JORGE MATIAS DUBEUX" "autor_nome_curto" => "MARCOS DUBEUX" "autor_email" => "marcosdubeux.bio@gmail.co" "autor_ies" => "UNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS" "autor_imagem" => "" "edicao_url" => "anais-i-conidis" "edicao_nome" => "Anais I CONIDIS" "edicao_evento" => "Congresso Internacional da Diversidade do Semiárido" "edicao_ano" => 2016 "edicao_pasta" => "anais/conidis/2016" "edicao_logo" => "5e4a0993d086e_17022020003339.png" "edicao_capa" => "5f184b878a264_22072020112159.jpg" "data_publicacao" => null "edicao_publicada_em" => "2016-11-09 23:00:00" "publicacao_id" => 33 "publicacao_nome" => "Anais CONIDIS" "publicacao_codigo" => "2526-186X" "tipo_codigo_id" => 1 "tipo_codigo_nome" => "ISSN" "tipo_publicacao_id" => 1 "tipo_publicacao_nome" => "ANAIS de Evento" ] #changes: [] #casts: array:14 [ "id" => "integer" "edicao_id" => "integer" "trabalho_id" => "integer" "inscrito_id" => "integer" "titulo" => "string" "resumo" => "string" "modalidade" => "string" "area_tematica" => "string" "palavra_chave" => "string" "idioma" => "string" "arquivo" => "string" "created_at" => "datetime" "updated_at" => "datetime" "ativo" => "boolean" ] #classCastCache: [] #attributeCastCache: [] #dates: [] #dateFormat: null #appends: [] #dispatchesEvents: [] #observables: [] #relations: [] #touches: [] +timestamps: false #hidden: [] #visible: [] +fillable: array:13 [ 0 => "edicao_id" 1 => "trabalho_id" 2 => "inscrito_id" 3 => "titulo" 4 => "resumo" 5 => "modalidade" 6 => "area_tematica" 7 => "palavra_chave" 8 => "idioma" 9 => "arquivo" 10 => "created_at" 11 => "updated_at" 12 => "ativo" ] #guarded: array:1 [ 0 => "*" ] }