O presente trabalho tem como objetivo investigar o uso da ferramenta digital WebQuest como estratégia didática para promoção da Alfabetização Científica (AC) e o combate a Cegueira Botânica (CB). Para dar materialidade a esse objetivo, a Sequência Didática (SD) Del-Corso e Trivelato (2019) foi transposta para WebQuest seguindo as diretrizes dessa estratégia didática. A proposta foi implementada em uma escola técnica pública na cidade de São Paulo com 150 estudantes. Tanto o planejamento como a realização das atividades foram desenvolvidos no contexto da pandemia COVID-19 no ano de 2021. Os resultados apontam que a WebQuest é uma ferramenta potente para organizar materiais e engajar os estudantes no Ensino Remoto, disponibilizando recursos aos professores para identificar dificuldades no aprendizado de Ensino de Ciências e orientar possíveis alternativas para AC sobre botânica.