Nos cursos técnicos a bioquímica costuma ser ministrada com ênfase na memorização. Porém, o técnico em Química, por atuar em áreas como a ecotoxicologia, necessita da integração de diversas áreas do conhecimento. Nesta perspectiva, a Aprendizagem Baseada em Problemas (ABP) apresenta-se como uma alternativa. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar as percepções dos alunos do curso de Técnico em Química sobre a utilização da ABP para o ensino de bioquímica utilizando o tema agrotóxico. Em nossa proposta, os alunos foram expostos a situações motivadoras almejando a construção autodirigida e coletiva do conhecimento, seguida da aplicação de um questionário de avaliação do método. Diante dos conteúdos abordados e das vivências possibilitadas, observamos que este método contribuiu para a aprendizagem dos discentes e acreditamos que a ABP pode ser utilizada em cursos técnicos que visem a formação de indivíduos críticos e conscientes de suas responsabilidades enquanto cidadãos.