Introdução. O Acidente Vascular Encefálico (AVE) é a doença neurológica que mais acomete o sistema nervoso. Após o evento, apenas 30% a 66% dos indivíduos conseguirão usar o Membro Superior Parético (MSP) de maneira funcional. Sua incidência sobe rapidamente com o aumento da idade, dois terços ocorrem em pessoas acima de 65 anos, e depois dos 55 anos, o risco duplica a cada 10 anos. A Estimulação Magnética Transcraniana (EMT) vem sendo empregada no tratamento desses indivíduos de forma a promover a estimulação do córtex humano e reorganizar o metabolismo cortical. Objetivo. Verificar os efeitos da aplicação da Estimulação Magnética Transcraniana repetitiva (EMTr) e a Fisioterapia sobre a habilidade manual de idosos com AVE. Métodos. Pesquisa experimental, realizada no período de 2011 à 2012. A amostra foi composta de 13 idosos pós-AVE crônico, divididos aleatoriamente em três grupos: grupo A, submetido à EMTr, grupo B, submetidos à fisioterapia e grupo C realizaram fisioterapia e EMTr. Foram utilizados na coleta de dados ficha sócio-demográfica e clínica, o Mini-exame do estado mental (MEEM) corrigido para escolaridade e Purdue Pegboard Test para avaliação da habilidade manual. As intervenções foram realizadas 3 vezes por semana, com duração de 60 minutos, em um período de 2 meses. Os dados foram analisados no SPSS versão 20.0, onde foi realizada a análise descritiva utilizando distribuição de frequência, medidas de tendência central e dispersão. Para a análise inferencial realizou o teste de Wilcoxon para comparar o estado pré-tratamento e pós-tratamento e o teste de Kruskal-Wallis para comparação entre os dos grupos. Adotou-se como nível de significância uma probabilidade de 5% de se cometer um erro tipo I. A pesquisa foi aprovada pelo Comitê de Ética em Pesquisa da UEPB, e todos os indivíduos assinaram o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido – TCLE. Resultados. Houve uma melhora significativa da mão não-afetada no grupo de fisioterapia (p<0,05), enquanto no grupo de associação das técnicas essa melhora tendenciou a significância (p=0,06). Conclusões. A fisioterapia como forma de tratamento dos pacientes sequelados de hemiparesia, obteve valores com significância estatística para habilidade manual da mão parética e os indivíduos submetidos à intervenção com associação das técnicas, EMTr e fisioterapia, tendenciaram a melhora dessa habilidade manual no MSNP, sugerindo que a EMTr possa ter provocado uma diminuição da excitabilidade cortical, na tentativa de estimular a solicitação da atuação do córtex lesionado.