Os sistemas rio-planície de inundação são compostos por ambientes e feições morfológicas complexas dos pontos de vista hidrológico e hidrodinâmico. Nesse contexto, o presente trabalho objetivou analisar o comportamento sazonal das águas no baixo rio Sepotuba, Pantanal Norte – Brasil. Para tanto, realizou-se levantamento de dados primários e secundários sobre os períodos de cheia e de vazante no rio Sepotuba, bem como das transições (esvaziamento e enchimento). Com isso, procedeu-se com a espacialização das áreas inundadas e da conectividade, conforme a sazonalidade, no baixo curso do rio Sepotuba aplicou-se o Índice de Água de Diferença Normalizada Modificada – MDWI. Constatou-se que, o período com maior ocorrência de áreas úmidas de fato foi registrado em março de 2023 quando a área ocupada por água foi de 17,6 km², o que representou 7,8% da área total do sistema. Enquanto que, os períodos de transição ocorreram nos meses de dezembro (2022 e 2023) e junho de 2023, enquanto que a vazante em setembro de 2023. É importante salientar que em dezembro de 2023 a área detectada pelo MDWI foi menor com 12,33 km² menor em relação a dezembro de 2022 (15,27 km²), ou seja, houve uma entrada menor de água no sistema e, consequentemente, registrou-se diminuição de áreas úmidas (-19,25%). Assim, a obtenção do MDWI, contendo apenas dados de água em arquivo vetorial, permitiu uma melhor visualização do comportamento das águas (por transbordamento ou áreas úmidas) e dos pontos em que ocorrem conectividade entre os canais e os ambientes fluviais.