Como os estudos morfoanatômicos são realizados na avaliação do controle de qualidade de plantas medicinais, objetivou-se com esta pesquisa, identificar as variações morfoanatômicas de partes aéreas vegetativas de alecrim (Rosmarinus officinalis L.), provenientes de sistemas de cultivos orgânico e convencional. As análises morfológicas (comprimento da parte aérea, diâmetro do caule e comprimento, largura e espessura da folha) e anatômicas (espessura da epiderme do caule; espessura da epiderme abaxial e adaxial da folha; e diâmetro do feixe vascular da folha) foram feitas com plantas cultivadas nos sistemas convencional e orgânico, adquiridas com agricultores do brejo paraibano. O alecrim no sistema orgânico apresentou menor o comprimento, largura e espessura da folha, no entanto houve aumento da parte aérea e na espessura da epiderme do caule quando comparado às amostras coletadas no sistema convencional. Os sistemas de cultivo analisados proporcionaram diferentes influências na morfoanatomia do caule e da folha do alecrim. Em relação as análises morfológicas, o sistema convencional apresentou maiores resultados. Quando as análises anatômicas, o sistema orgânico proporcionou melhores resultados. Assim, é indicado o cultivo das plantas provenientes do sistema orgânico, até porque a utilização dessa planta é para fins medicinais.