O Sistema Nervoso Central é um complexo anatômico diretamente relacionado as funções motoras e comportamentais de um organismo, entretanto, pouco se sabe sobre esse complexo em peixes. Baseado nisso, comparamos os encéfalos de juvenis de duas populações de Cichla piquiti buscando encontrar variações. O material utilizado é proveniente do Reservatório de Lajeado - TO (nativos), do rio Javaés Pium – TO (nativos) e do Reservatório de Furnas – MG (não-nativos). Utilizamos os volumes de cada estrutura do encéfalo para comparações, os valores foram logaritmizados e divididos pelo comprimento padrão para evitar interferências de tamanho entre as amostras, e utilizamos exemplares adultos do Javaés como parâmetro. Utilizamos uma Análise de Componentes Principais (PCA) e uma Análise de Covariância (ANCOVA) para entender a relação entre volume vs. tamanho vs. localidade. A PCA indicou que o Tectum opticum, Telencephalon, Bulbus olfactorius, Corpus cerebellaris, Lobus inferior hypothalami e Lobus gustativus correlacionam-se positivamente com indivíduos do Tocantins, sendo 65,56% explicada pelo eixo PC1, todos os exemplares de Furnas se posicionaram contra as cargas da PCA. Quando analisadas as ANCOVAS, o Tectum opticum, Corpus cerebellaris e Lobus gustativus foram proporcionalmente maiores em indivíduos provenientes do Tocantins. Nossos resultados indicam que juvenis de C. piquiti em condição nativa possuem algumas estruturas encefálicas proporcionalmente maiores quando comparados com a população de Furnas. Uma possível explicação para este fato, é a pressão de predação e competição, uma vez que na bacia do rio Tocantins, a diversidade de predadores e competidores é maior. Logo, essa pressão pode induzir os juvenis a terem estruturas específicas do encéfalo maior, como o Corpus cerebellaris, por exemplo, fundamental para coordenação motora e agilidade para fugir de possíveis predadores. Novos estudos são necessários ampliando o número de amostras e localidades para melhor compreensão das interações do meio com diferentes populações e seu reflexo no SNC.
